Budi daya perairan (juga disebut akuakultur) merupakan bentuk pemeliharaan dan penangkaran berbagai macam hewan atau tumbuhan perairan yang menggunakan air sebagai komponen pokoknya. Kegiatan-kegiatan yang umum termasuk di dalamnya adalah budi daya ikan, budi daya udang, budi daya tiram, budi daya rumput laut (alga). Budi daya perairan adalah bentuk perikanan budi daya, untuk dipertentangkan dengan perikanan tangkap. Di Indonesia, budi daya perairan dilakukan melalui berbagai sarana. Kegiatan budi daya yang paling umum dilakukan di kolam/empang, tambak, tangki, karamba, serta karamba apung.
Jurusan Budidaya Perairan mempelajari tentang segala hal tentang budidaya, baik itu ikan air laut, ikan air tawar, udang, lele, cumi-cumi, lobster, mutiara, rumput laut, dan berbagai jenis ikan serta biota yang lain. Mahasiswa jurusan ini belajar teknik penangkapan ikan yang ada di laut ataupun di perairan darat seperti sungai, danau, dengan perantara para nelayan, pelabuhan, kapal-kapal perikanan, dan lain sebagainya.